学校下设25个院部，开设28个本科专业、10个专科专业，有6个国家级特色专业、6个自治区级重点专业，9个国家级一流本科专业建设点、7个自治区级一流本科专业建设点，4个国家级一流本科课程、6个自治区级一流本科课程，1个国家级人才培养模式创新实验区。现有医学、理学、工学、管理学、法学5个学科门类，形成了以医学为主，其它学科相辅相成的学科结构与布局。临床医学学科进入ESI全球排名前2.63‰，药理学与毒理学位列ESI全球排名前1%。4个学科入选自治区“十四五”重点学科建设序列，其中临床医学入选优势学科（自治区一流学科），药学、中医学、公共卫生与预防医学入选特色学科。有5个一级学科博士学位授权点、2个专业博士学位授权点；13个一级学科硕士学位授权点、8个硕士专业学位授权点；4个博士后科研流动站、4个博士后科研工作站。

学校现有科技部省部共建国家重点实验室1个、国家级实验研究基地1个、科技部国家国际科技合作基地1个、国家临床医学研究中心分中心9个、教育部省部共建实验室1个、教育部高等学校学科创新引智计划1个、教育部国际合作联合实验室1个、教育部省部共建协同创新中心1个、教育部工程研究中心1个、自治区级重点实验室14个、自治区临床医学研究中心4个、自治区工程研究中心2个、人文社会科学重点研究平台1个、自治区科普教育基地5个。2022年共获项目820项，经费近2.12亿元，其中国家自然科学基金项目66项，创近10年新高。获自治区科学技术奖15项，其中突出贡献奖1项，一等奖4项，二等奖6项，三等奖4项。

学校所辖8所直属附属医院,坚持以人民为中心的发展思想，以满足疑难危重疾病救治和新疆、周边国家特高发疾病临床需求为导向，围绕丝绸之路经济带核心区医疗服务中心建设，充分发挥全疆医疗系统主力军优势，主动服务国家战略和区域社会经济发展，各附属医院形成了优势集中、特色鲜明、错位发展、整体联动，具有较高社会知名度和影响力的医疗资源集群，为健康中国战略、健康新疆建设做出了积极贡献。

学校不断加强与国内外知名高校的交流合作，与中南大学、吉林大学、北京中医药大学、中国药科大学、温州医科大学建立了全面对口支援协作关系，与复旦大学、中山大学、南京医科大学等20余所大学建立了深层次共建合作关系。与俄罗斯、日本、英国、塔吉克斯坦、格鲁吉亚、哈萨克斯坦等多个国家的大学及研究机构建立了校际合作关系。是自治区首批来疆留学高校示范基地、首批接受政府奖学金的高校，被教育部授予来华留学生教育先进集体，培养了来自印度、巴基斯坦、哈萨克斯坦等39个国家的百余名研究生、上千余名本科生。

立足新时代，开启新征程。新疆医科大学将高举习近平新时代中国特色社会主义思想伟大旗帜，深入学习贯彻党的二十大精神，完整准确贯彻新时代党的治疆方略，紧紧围绕立德树人根本任务，肩负“健康中国”战略历史使命，不忘初心、矢志奉献，努力办好党和人民满意的高等医学教育和医疗服务，为建设新时代中国特色社会主义新疆贡献力量。